Botanická zahrada Chotobuz přirozeně navazuje na Průhonický park obklopující Průhonický zámek. Zahrada stejně jako park spadá pod Botanický ústav AV ČR a jde vlastně o jeho genofondovou sbírku. Vznikla z areálu pomologického arboreta (sbírky ovocných stromů), které se sem začalo stěhovat na počátku 40. let 20. století. Po válce přecházelo pod různé instituce, až bylo nakonec roku 1956 navrženo jeho zrušení. Roku 1963 v areálu vznikla botanická zahrada Československé akademie věd a začaly se zde soustředit genofondové sbírky vybraných rodů rostlin. Zahrada dlouho nebyla přístupná veřejnosti. To se změnilo v první polovině 90. let, kdy byla vybudována genofondová expoziční zahrada s výměrou 4 hektary. Zde jsou soustředěny reprezentativní sbírky vybraných rostlin. Setkáváme se tu s velkou sbírkou růží (690 hybridů), obrovskou, světově významnou sbírkou kosatců (200 druhů a variet a téměř 2000 kultivarů), dále denivek (16 druhů a 280 kultivarů), rododendronů a vřesovcovitých rostlin, pivoněk a dalších skupin. Nechybí ani vodní plochy se sbírkou leknínů. Z původního fruticeta se dochovala řada odrůd hrušní a jabloní. Sbírky rostlin jsou řazeny chronologicky a jejich cílem je uchovat genovou variabilitu vybraných skupin. Zahrada je otevřená pro veřejnost vždy v květnu a červnu v pracovní dny.
